Fachgebiet für Mikrobiom & Angewandte Bioinformatik

Fachgebiet für Mikrobiom & Angewandte Bioinformatik

©IngridHilbert

Forschungsschwerpunkte

  • Aufbau und Struktur des Magen-Mikrobioms im funktionellen Kontext des Gastrointestinaltrakts
  • Dysbiose, Durchfall und Entzündung: Intrinsische Mikrobiom-Organisation und Mensch/Mikrobiome-Interaktionen
  • Personalisierte Ernährung: Assoziation mit taxonomischen, metabolischen und funktionellen Mikrobiom-Parametern
  • Mikrobiom-Transplantation: Etablierung, Stabilität und therapeutische Modulation des Mikrobioms

Methoden

  • Mikrobielle Genomik und bioinformatische Sequenzanalyse
  • Quantitative taxonomische und funktionelle Charakterisierung des Mikrobioms
  • DNA/RNA-basierte Hochdurchsatz-Sequenzierung
  • Stamm-basierte metagenomische Mikrobiom-Analyse

Wir untersuchen das Mikrobiom mithilfe genomischer und anderer 'omics Methoden, für deren Analyse wir neue bioinformatische Ansätze entwickeln. Im Fokus unseres Interesses stehen die Identifikation und vergleichende Analyse von Faktoren, die über die Zusammensetzung und Funktion des Mikrobioms entscheiden. Mit diesem Wissen erweitern wir unser Verständnis von Mikrobiom-basierten Erkrankungen und legen die Grundlagen für die Entwicklung neuer Therapieansätze.

Fachgebiet für Mikrobiom & Angewandte Bioinformatik (140d)

Garbenstraße 30
Bio1.U2
70599 Stuttgart

Postadresse:
Universität Hohenheim
Fachgebiet für Mikrobiom & Angewandte Bioinformatik (140d)
70593 Stuttgart

0711 459 24840
E-Mail

Forschungsprojekte (Auswahl)

Magen-Mikrobiom
Funktion des Magens im Kontext von gastrischer und intestinaler Dysbiose und nach bariatrischer Chirurgie – Kooperation mit der Medizinischen Universität Graz (Österreich) und der Sana Klinik Bethesda Stuttgart

Neonatales Mikrobiom
Einfluss von Geburt und mikrobiellem Transfer auf die Entwicklung und Funktion des neonatalen Mikrobioms – DFG-geförderter Kooperation mit dem Olgahospital Stuttgart

Mikrobiom-Transplantation
Mechanismen und Folgen der Stuhltransplantation (FMT) und Grundlagen von Mikrobiom-Stabilität, -Transfer und -Modulation – Kooperation mit dem Sinai Hospital Baltimore (USA) und der Medizinischen Universität Graz (Österreich)

Mikrobielle Stamm-Analyse
Entwicklung bioinformatischer Werkzeuge zur Identifikation und vergleichenden Analyse von mikrobiellen Stämmen in metagenomischen Datensätzen

Team

Andrade Binder, NilzaSekretariat / Verwaltung

Fricke, W. Florian, Prof. Dr. 

Leitung
Lendl, SimoneSekretariat / Verwaltung

 

Schmidt, NinaDoktorandin
Schumacher, MonikaLaborleitung
Ruple, Hannah
Doktorandin
Fritz, CarolinDoktorandin
Döbereiner, LisaM.Sc.
Maier, CarinaM.Sc.
Schintgen, LynnDoktorandin

Lehre

In der Lehre vertritt das Fachgebiet die Bereiche Mikrobiom, Nutrigenomik, Personalisierte Ernährung und Angewandte Bioinformatik in den ernährungswissenschaftlichen Bachelor- und Masterstudiengängen.

In den Bachelormodulen stehen molekularbiologische Grundlagen und die Einführung in Konzeption, methodische Grundlagen und Anwendungen der Nutrigenomik und Mikrobiomforschung im Mittelpunkt der Lehre. In den Mastermodulen wird dieses theoretische Wissen vertieft und durch praktische labor-experimentelle und bioinformatische Übungen ergänzt.

Im Vorlesungsverzeichnis in HohCampus finden Sie unsere Veranstaltungen unter Fakultät Naturwissenschaften > Ernährungswissenschaften (140) > Fg. Mikrobiom und Angewandte Bioinformatik (140d)

Publikationen & Forschungsprofil